El trasplante de microbiota fecal o FMT (por sus siglas en inglés) es el proceso mediante el cual se recolectan las heces de un donante sano y se trasplantan a un individuo enfermo. Similar al trasplante de órganos, el objetivo del FMT es mejorar la salud del receptor del trasplante.
El proceso de FMT no solo trasplanta microorganismos vivos y muertos, sino también pequeñas partículas de alimento, células del intestino delgado y grueso y productos metabólicos de las bacterias (Bojanova y Bordenstein 2016).
El mecanismo por el cual el FMT es eficaz no está bien definido para la mayoría de las enfermedades. Sin embargo, se cree que los beneficios derivados del FMT se deben a un aumento de microbios favorables, un aumento de la diversidad microbiana y a la estimulación de la inmunidad de la mucosa (Niederwerder 2018).
